藥用真菌的人工栽培，因真菌的種類、營養類型、環境條件及培養料的不同有多種多樣方式。主要的栽培方式有段木栽培、代料栽培和深層培養菌絲體。段木栽培是以原木等為栽培材料，人工接種，適用于林區。代料栽培是以工農業生產的廢棄物如鋸木屑、棉籽殼、甘蔗渣、玉米芯、農作物秸稈、麥麩等為原料，進行人工接種，可控性強，受自然條件影響較小，適應性廣。以上兩種均為在固體培養料上栽培，以獲得子實體和菌核為目的。有些藥用真菌目前還未能掌握其子實體形成的條件，其菌絲體或生長代謝產物具有一定的生理活性，而采用液體發酵或固體發酵方式進行生產。
一、段木栽培
    采用段木栽培的藥用真菌有靈芝、香菇、黑木耳、銀耳、金耳、豬苓、茯苓等。其生產工藝流程包括栽培場地的選擇、整理，段木的菌種準備，段木的人工接種，培菌起架管理，病蟲害防治及采收加工等。
    1.栽培場地選擇和整理 創造適宜藥用真菌生長的環境，選擇地勢相對較高、離水源近同時易于排水、周圍環境清潔、通風良好的場地，根據藥用真菌的生物學特性，不同種藥用真菌其栽培場地的選擇也有區別。