杭州市農科院蔬菜所菌種站的前身——杭州市菌種站成立于1981年，是浙江省最早從事食（藥）用菌名優新品種選育、栽培技術研究及培訓推廣的專業科研機構之一。成立三十多年來一直堅持“科研與生產相結合”、“技術服務與開發經營相結合”的指導方針，已累計完成省、市科研及推廣項目50余項，獲省、市科技成果獎10多項。現有中高級專業技術人員12名，主要研究方向為食（藥）用菌種質資源的收集評價與新品種選育、基于食用菌的農業廢棄物循環利用技術研究、食（藥）用菌新產品開發等。
2004年成立杭州市農科院以來，已先后承擔建設了“杭州市珍稀食用菌科技創新服務平臺”、“浙江省食用菌良種繁育基地”，擁有工廠化栽培實驗室、人工智能氣候室、專業菌包生產流水線、標準化示范菇棚等一流科研生產設施；是國家食用菌產業技術體系綜合試驗站之一，同時也是浙江省食用菌創新團隊和浙江省食用菌育種協作組的核心成員單位。
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