茶樹菇栽培過程會出現雜菌，應注意采取以下措施防治料袋受污染。
一是棉籽殼提前24小時加水堆制發酵，使料溫上升至60～70℃，以殺滅雜菌。
二是配料加入麥麩后，拌料裝袋上灶滅菌不超過6小時，以防基質酸敗。
三是滅菌時保持溫度在100℃以上24小時，中途不停火、不摻冷水、不降溫，以徹底滅菌。
四是滅菌后料袋搬運過程要輕拿輕放，防止料袋破損。
五是選擇晴天夜間接種，并嚴格執行無菌操作，防止雜菌進入。
六是菌袋發菌培養時注意控溫，以23～26℃為宜，注意防潮、通風、避光。
七是每隔7天翻堆檢查1次，發現有雜菌污染和病蟲危害時及時處理。
