標簽是菌種的重要標志，如果不貼標簽或標簽寫不標準，可能造成菌種錯亂，給制作者和使用者都帶來麻煩，甚至造成經濟損失。
一、標簽規格與貼法：標簽規格一般有兩種：菌種袋和菌種瓶的大標簽6×4厘米，試管的小標簽3×2厘米。標簽粘貼的位置，應在距離管口或袋口或瓶口2―5厘米處。標簽要求剪裁齊整，粘貼端正。常用化學粘膠水或加防腐劑的漿糊粘貼較好。塑料袋菌種可用白色醫用膠布或牛皮紙膠布作標簽。
二、標簽寫法：科研使用或母種、原種應填寫詳細標簽，短時期使用的生產種可寫簡明標簽或用標簽筆寫上標簽代號也可，減少工作量，適應生產的需要。詳細標簽第一橫行，從左至右（1）菌種名稱：可寫菌種拉丁文學名的第一或第一、二個字母，第一個字母用大寫，或寫中文字。如L（香菇）、Ag（雙孢蘑菇）、V（草菇）、Ar（蜜環菌）等。（2）初次分離時間，用阿拉伯數字寫年、月、日。（3）品系或菌株，包括品系間性狀的差別，不同的試驗處理等內容，用阿拉伯數字編代號。（4）菌種編號，包括從不同地方引入，不同的保藏方法，不同的試驗處理等內容，用阿拉伯數字編寫。第二橫行：（1）菌種級別：如一級、二級、三級或母種、原種、生產種。（2）分離方式：孢子分離用S表示、組織分離用T表示，菌絲移植用M表示等。（3）菌種來源：分為引種、自繁、保藏，分別寫引、自、保。（4）移植次數：用F字母，字母右下用小數字，表示從分離后轉接的次數。第三橫行：（1）接種日期，（2）制作單位，（3）菌種評價：優、良、中、差、劣五級。生產種可填寫簡明標簽：第一橫行：（1）菌種名稱，（2）分離時間，（3）品系。第二橫行：（1）菌種級別，（2）分離方式，（3）移接次數，（4）制作日期。第三橫行，制作單位。
