猴頭抗真菌、抗細菌、抗病毒的能力較強。因此，在栽培過程中發病較少，也較輕。以下簡要介紹猴頭菇生產中常見的病害及其防治。
　　猴頭菇生產中常見的一種現象是子實體萎縮，即子實體前期生長正常，后來菌刺就萎縮倒伏，菇體皺縮。這是非病原病害，是由于溫度過高，空氣干燥，子實體缺水而造成的。應及時噴霧菇房空間，提高室內空氣相對濕度至85%。
　　非病原病害是由于不適宜的環境條件或不恰當的栽培措施所引起的。如培養料含水量過高或過低，pH過小或過大。空氣相對濕度過大或過小，光線過強或過弱，二氧化碳氣體濃度過濃，農藥、生長調節物質等使用不當等因素所引起，這類病害是不會傳染的。猴頭菇發生比較嚴重畸形菇，就屬于這種病害。
　　猴頭菇生產中常見的另一種現象是子實體萎縮后不久又變褐發霉，這是被霉菌侵染，為病原病害。應加強菇房通風，降低室內濕度，并在患處涂抹3%的漂白粉溶液，或1%石灰溶液，防止其蔓延。
　　病原病害是由于受到有害微生物的寄生而引發的病害，也叫侵染性病害。病原病害具有傳染性，所以也叫傳染性病害。引起猴頭菇發病的生物統稱為病原物。病原物主要有真菌、細菌、病毒等。
　　病原病害防治，除認真執行前面所述綜合防治的各項措施外，也可運用藥劑防治：
　　真菌病害：多菌靈1:500倍，或硫酸銅0.5～1%水溶液噴灑，或苯菌靈1:500倍噴灑，或甲基托布津1:500倍噴灑，或百菌清0.15水溶液噴灑，或代森鋅0.1%水溶液噴灑。
　　細菌病害：甲醛5%水溶液噴灑，或石碳酸3%～4%水溶液噴灑，或氯化碳3%水溶液噴霧，或漂白粉0.5%～1%水溶液噴霧，或金霉素1:500倍噴灑。
　　病毒病害：對患病毒病的菇房清洗消毒；菌絲生長期間料面覆蓋，防止病毒侵入。（山西農業大學食用菌科技服務中心   賈靜）