在山西栽培靈芝過程中常見的蟲害有：
 
1.球覃甲：屬鞘翅目球覃甲科，是靈芝生產上的一種主要害蟲，幼蟲為害主要鉆蛀取食，從芝蓋或芝柄侵入，在表面留下小圓孔。
2.靈芝造橋蟲：屬鱗翅目尺蠖科。該蟲危害靈芝子實體，初齡幼蟲在菌蓋表面和邊緣取食，造成凹陷和缺刻，3齡以后可直接蛀入子實體內部，同時排出大量糞便，不僅污染菇體，同時招致綠霉菌等雜草繁衍，有害靈芝生長，使產量降低、品質受損。
3.靈芝谷蛾：屬鱗翅目，谷蛾科昆蟲。靈芝谷蛾在靈芝原基形成到芝蓋生長期都危害靈芝子實體，越冬幼蟲一般在5月中下旬化蛹羽化，幼蟲從子實體的幼嫩部位蛀食進入，使菌蓋出現許多蛀食孔道，并排出成串的顆粒狀糞便，氣候潮濕時，排出物粘結引起靈芝子實體腐爛，成熟幼蟲在靈芝的蛀孔內做繭化蛹，羽化后蛹殼被成蟲帶出蟲道口，一年發生2－3代，以幼蟲做繭越冬。
4.靈芝夜蛾：屬鱗翅目，夜蛾科昆蟲。該蟲以幼蟲取食靈芝菌蓋背的菌肉，造成彎曲隧道，蟲道兩旁布滿褐色子實體粉末和蟲糞。
5.黑腹果蠅：雙翅目果蠅科。幼蟲取食菌絲體和培養料，使菌塊表面發生水漬狀腐爛，并能鉆食芝體，導致子實體萎縮腐爛。
6.跳蟲：跳蟲也叫煙灰蟲、香灰蟲、彈尾蟲，在靈芝上危害的常見是紫跳蟲。跳蟲群居危害靈芝菌絲，取食子實體菌蓋，使靈芝菌蓋出現不規則凹點或缺刻，降低產品質量，一年可發生6－7代。
7.螨類：不僅取食靈芝菌絲、子實體，使菌絲萎縮變色，以至消失,造成栽培失敗，而且還傳播木霉、黑孢霉、鐮刀菌等,菌種感染后，使菌絲稀少，退化，常給制種和栽培帶來很大損失。
8.白蟻：主要蛀食靈芝段木，在靠近地面的一端筑泥路挖洞，鉆人段木皮層下蛀食做巢，以段木及菌絲體做食料，然后逐步擴展成分支隧道式洞穴，不僅損壞段木樹皮還能蛀食木質內部。蛀出多個不規則的孔洞，孔洞四周敷著泥土，被害的食用菌產量受到較大影響。
9.蛞蝓：主要有黃蛞蝓和雙線嗜粘質蛞蝓。幼蟲與成蟲均取食子實體，常將菌蓋咬成缺刻，造成子實體殘缺不全。