金針菇子實體生長發育階段，菌柄基部變黑褐色至黑色糜爛，基部糜爛后，子實體倒伏。幼菇叢發病雖不倒伏，但不能延續向上生長發育，嚴重發生時，針狀的幼菇成叢變黑糜爛。

病原：瓶梗青霉，屬半知菌亞門、絲孢綱、叢梗抱目、叢梗抱科，該病原如在馬鈴薯蔗糖培養基上，菌絲白色、粉狀。培養基呈深紅褐色，菌落呈粉紅色。抱子梗從氣生菌絲上長出，呈對稱分叉。與青霉素的分枝類似，但小枝梗頂端著生的分生孢子可形成長鏈，鏈長達400—600微米，分生孢子橢圓形、單細胞、無色。

發生：各地均有發生，以室內床栽較多。多發生于棉籽殼生料栽培的菇床上，生長階段培養料含水量過高，床面長時間有積水，加之長時間覆蓋薄膜，通風不良，濕渡過大，有利發生。

防治：子實體生長階段節制適宜的含水量，經常消除床面積水，特別是在子實休生長階段消除積水特別重要。發現病菇后應及時消除，可收到一定的防治效果。