目前有機滑菇菌棒接種方式有二種：一種是用接種箱法，另一種是開放式接種法。該方法是近年來為適合單戶種植數量增加，在接種箱基礎上改進而來的一種實用接種法。
(1)料棒冷卻 開放式接種法的冷卻場所即為接種場所，因此冷卻場所必須相對密封，衛生條件較好的環境，面積不超過50平方米，若空間太大，則應掛接種帳蓬(用8絲農用薄膜制成的2米×2米×2米的薄膜帳)，將已滅菌的料棒搬入接種室，數量為1000-2500袋，冷卻過程中注意保持料棒在冷卻過程中不受或少受外界不潔空氣的影響。
(2)消毒 將菌種及其他物品放置料棒堆上，然后用氣霧消毒劑4-5盒(160-200克)點燃，并用薄膜把料棒覆蓋嚴密，盡量不要讓氣霧消毒劑的煙霧逸出來，消毒時間3-6小時。
(3)接種前放氣 開放式接種先把房門打開，用塑料棚帳式接種的則可把帳門打開，再將覆蓋料棒的薄膜掀開一部分，一直放到接種人員能夠忍耐，即可進行接種。接種時實行開門操作，以減少室內溫度升高。菌種預處理、接種方法同接種箱。
(4)接種后的管理 對于不用套袋而采用地膜膠水封口或菌種封口(也稱不封口)，應將各種殘留雜物清理干凈，污濁空氣排完后將薄膜重新覆蓋菌棒堆。每天清晨或夜里掀膜一次，約5-7天菌種成活定植后即可去膜或去篷翻堆，實踐表明，這樣做可大大提高成活率。
