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    擴(kuò)增青霉鈣調(diào)蛋白基因部分區(qū)域的引物設(shè)計(jì)(英文)


    【發(fā)布日期】:2018-02-28  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】王龍 莊文穎
    【機(jī)構(gòu)】中國科學(xué)院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中國科學(xué)院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 北京100080中國科學(xué)院研究生院,北京100080
    【摘要】在本研究中,基于某些模型生物的鈣調(diào)蛋白氨基酸序列及其基因序列,一套用于擴(kuò)增其部分區(qū)域的PCR引物被設(shè)計(jì)出來。為了與傳統(tǒng)分類方法相整合,基因組DNA的提取及擴(kuò)增的方法均得到了改進(jìn)和優(yōu)化。用這套引物和方法,在青霉的鈣調(diào)蛋白基因中從編碼第9個(gè)氨基酸---谷氨酰胺(Gln)的密碼子的第3個(gè)核苷酸到編碼第122個(gè)氨基酸---纈氨酸(Val)的密碼子的第3個(gè)核苷酸被成功擴(kuò)增出來。這個(gè)區(qū)段包含了青霉鈣調(diào)蛋白基因第2和第5外元(exon)的部分序列和全部三個(gè)內(nèi)元 (intron) 序列約600bp左右,可直接進(jìn)行雙向直通測序,非常適用于青霉的種系學(xué)研究。 
    【關(guān)鍵詞】DNA提取; PCR; 種系學(xué); 正青霉; 籃狀菌; 青霉菌;
     
     
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