【作者】劉朋虎 謝寶貴 鄧優(yōu)錦 江玉姬

【機(jī)構(gòu)】福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心國家菌草工程技術(shù)研究中心

【摘要】從福建主栽品種屏優(yōu)一號PY分離到2個(gè)不能正常出菇的單孢菌株P(guān)Yd21、PYd15,二者配對雜交得到可正常出菇異核菌株H15-21。用solexa測序技術(shù)對PYd21基因組從頭測序(de novo sequencing),對PYd15、PYd21、H15-21的菌絲體分別進(jìn)行數(shù)字基因表達(dá)譜測序,對8個(gè)樣品(PYd15、PYd21、H15-21的菌絲體,H15-21出菇后的原基、鈕扣期菌柄、蛋形期菌柄、伸長期菌柄和成熟期菌柄)mRNA等量混合物進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。克隆測序了PYd21與PYd15中磷酸果糖激酶(PFK)基因,比對結(jié)果表明二者序列一致。利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對PFK基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,結(jié)果表明:該基因全長3,494bp,有12個(gè)外顯子、11個(gè)內(nèi)含子;開放閱讀框(ORF)全長2,457bp,編碼818個(gè)氨基酸,5′端非翻譯區(qū)(5′UTR)長度281bp,3′端非翻譯區(qū)(3′UTR)全長103bp;RNA在加工過程中存在1種可變剪切類型、6個(gè)可變剪切位點(diǎn)。數(shù)字基因表達(dá)譜分析結(jié)果表明,PFK基因在PYd21、PYd15及H15-21中的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量分別為71.08、120.61、251.85(transcriptper million cleantags,TPM),表達(dá)量依次升高,與菌絲生長速度顯著正相關(guān)。并且異核菌株H15-21表達(dá)量高于2個(gè)單孢菌株之和,基因表達(dá)存在協(xié)同增效作用。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對基因表達(dá)量進(jìn)行驗(yàn)證,表達(dá)譜數(shù)據(jù)切實(shí)可靠。

【基金】國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(No.CARS24)；

【關(guān)鍵詞】草菇; 基因結(jié)構(gòu); 可變剪切; 協(xié)同增效; 異核體;