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    基于全基因組數據解析傘菌目木質纖維素降解酶系的差異


    【發布日期】:2019-01-24  【來源】:菌物學報
    【作者】楊瑞恒李燕唐利華李傳華鮑大鵬
    【機構】國家食用菌工程技術研究中心農業部南方食用菌資源利用重點實驗室上海市農業遺傳育種重點實驗室上海市農業科學院食用菌研究所
    摘要:傘菌目Agaricales隸屬于擔子菌門Basidiomycota、傘菌亞門Agaricomycotina,是擔子菌門中最大的一個類群,能夠以腐生、寄生以及共生的模式在自然環境中生存,生存范圍廣,對于維持生態環境的平衡具有重要的作用。本研究基于51株傘菌目真菌基因組大數據挖掘降解木質纖維素相關的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)和氧化還原酶(oxidoreductases),同時比較白腐菌、褐腐菌、腐生菌、菌根菌、植物致病菌、兼性寄生菌、動物共生菌和不明生態型真菌降解機制的差異。結果顯示白腐菌和褐腐菌等木腐菌、菌根菌、兼性寄生菌、其他腐生菌、植物致病菌以及共生菌的CAZymes家族平均數目為134個、93個、101個、127個、61個和32個,而CAZymes同源的基因平均數目為398個、240個、463個、407個、418個、131個和38個,木腐菌的CAZymes家族最為豐富,但是兼性寄生菌基因數目最多;同時具有木質纖維素降解酶活性的26個家族中,基因數目分別為86個、32個、101個、86個、104個、36個和10個。在木腐... 更多
     
    基金:上海市科技興農重點攻關項目[滬農科攻字(2016)第6-1-3號; 滬農科攻字(2015)第6-2-1; 滬農科攻字(2014)第7-1-6]; 上海市市級農口系統青年人才成長計劃[滬農青字(2015)第1-9號]; 國家食用菌工程研究中心(16DZ2281300)~~;
     
    關鍵詞:基因組規模; 傘菌目; 碳水化合物活性酶; 氧化還原酶;
     
     
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