培養料發酵質量的好壞，直接影響雙孢菇的生產。在雙孢菇培養料發酵中，不少菇農由于輕視對培養料的發酵，從而造成產量與質量的下降。栽培雙孢菇時，培養料發酵要掌握以下幾點：　　
　　發酵時間較佳的發酵時間在8月上旬，因為此時發酵培養料，可利用秋季溫度從高到低的有利條件，爭取較長的出菇期，取得較好的效益。度從高到低的有利條件，爭取較長的出菇期，取得較好的效益。　　
　　培養料的選擇所有培養料都要求新鮮，不得有霉變。　　
　　發酵首先，培養料預濕要充分，避免出現培養料吸水不足的現象。其次，建堆要科學，應采取南北走向，料堆寬度1.8～2米，高度1.5～1.8米，下層用磚塊修建通風道。按照建堆要求，一層料一層糞堆疊，同時注意培養料的含水量保持在65%左右。第三，注意翻堆要合理，如采取一次性發酵，要翻堆4次，從建堆開始計算天數，第一次翻堆在第七天，然后是第六天、第五天、第四天，發酵結束立即拆堆進房；如采取二次發酵，要翻堆3次，分別在第五天、第四天、第三天。在翻堆時應使糞草、內外層料均勻一致，防止出現夾生料，同時注意培養料的含水量始終保持在65%左右。第四，培養料要防止雨淋，下雨時用薄膜覆蓋，雨停揭去，防止悶料。　　
　　正確掌握培養料腐熟度栽培雙孢菇的培養料以半腐熟為宜。半腐熟的培養料具有以下四個特征：一是糞草的色澤由金黃色或黃綠色變成褐色，但不呈黑色，且無糞臭、酸臭或腐敗的味道。二是草莖柔軟，手拉時有一股抗拉力，富有彈性，而不是輕拉即斷，更非腐熟得看不出是草莖。手握培養料，能被握成團，松手后能自然松散。三是在最后一次翻堆后的第五天，培養料的溫度仍保持在50℃以上，但不得超過60℃。四是培養料堆的體積比原來縮小40%，重量減輕30%，含水量在60%左右，手捏時指縫間沒有水滴出現。