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    基于ITS序列的靈芝遺傳多樣性與群體遺傳分化研究


    【發布日期】:2019-01-25  【來源】:菌物學報
    【作者】劉雪瑩 韓玉立 司靜 李春道 崔寶凱
    【機構】北京林業大學微生物研究所臨沂市生產力促進中心
    摘要:本研究基于ITS序列對中國8個不同地理群體的168份靈芝樣本的分子變異、遺傳多樣性、群體遺傳分化程度進行了分析。結果表明:168個樣品中共檢測到39個單倍型(H1-H39),表現出較低的遺傳多樣性水平(Hd=0.867±0.018,Pi=0.00304±0.00024),各群體的遺傳多樣性水平相差不大;TCS單倍型網絡圖和基于ML、NJ法構建的單倍型系統發育樹顯示,各地理群體的遺傳距離與地理距離之間沒有形成對應關系,二者沒有明顯的相關性;AMOVA分析結果顯示不同地理群體間的遺傳變異占4.33%,群體內的變異占95.67%,遺傳分化主要來自于群體內部。總體和各地理群體的中性檢驗結果顯示,群體擴張遵循中性進化,群體大小保持相對穩定。整體的遺傳分化指數Fst為0.04331,基因流Nm為2.99,表明各地理群體間存在頻繁的基因交流,群體遺傳分化較小。推測原因可能為種群擴張歷史較短,分布范圍較窄,造成遺傳多樣性偏低,各群體間遺傳分化不大。 
     
    基金:國家自然科學基金(31670016)~~;
     
    關鍵詞:ITS序列; 分子標記; 單倍型; 基因流; 藥用菌;
     
     
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