【作者】徐珍 劉建雨 張丹 王瑞娟 潘迎捷 譚琦 尚曉冬
【機構】上海海洋大學食品學院 上海市農業科學院食用菌研究所 農業部南方食用菌資源利用重點實驗室 國家食用菌工程技術研究中心國家食用菌加工技術研發中心 上海市農業遺傳育種重點開放實驗室
摘要：以金針菇(Flammulinavelutipes)單核菌株DAN3的基因組為參考,完成單核體DAN3和M及其雜交雙核體G1在菌絲階段的轉錄組測序與數據分析,比較兩個樣本間的差異基因,并對差異基因進行GO功能分析和KEGG pathway分析。結果表明:兩個樣本中共有顯著性差異表達的基因86個,其中,在G1中呈上調、下調表達的基因數分別為41、45個,有2個基因在G1中特異表達。GO功能分析結果表明,86個差異基因中有40個基因比對上了GO功能注釋,其中18個基因在G1中呈上調表達;單一生物過程和催化活性為顯著性富集的功能,相關基因在G1中呈上調表達。KEGG pathway分析結果表明,22個差異基因被定位到17條Pathway,其中10個基因在G1中呈上調表達,包括賴氨酸代謝途徑對應基因,3_M和G1菌絲樣品中賴氨酸含量分別為1.70×103 ng/mg和1.06×103 ng/mg,說明G1中上調的基因可能與之降解相關;DNA復制是顯著性富集的代謝途徑,相關基因在G1中呈下調表達。
基金：國家科技支撐項目(2013BAD16802)資助；
關鍵詞：菌絲; 轉錄組; 差異表達基因; GO功能分析; KEGG pathway分析;