【作者】馬橙 陳作紅 張平

【機(jī)構(gòu)】湖南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院應(yīng)用真菌研究室

【摘要】以SNPs作為分子標(biāo)記,對(duì)黑柄炭角菌的生活史和遺傳多樣性進(jìn)行研究。基于黑柄炭角菌的基因組文庫(kù),在兩個(gè)菌株(X-WC和X-LY)的34個(gè)片段(19,680bp)中共發(fā)現(xiàn)193個(gè)SNPs,SNP發(fā)生率為0.981%。193個(gè)SNPs位點(diǎn)都有兩個(gè)可變的核苷酸,其中132個(gè)轉(zhuǎn)換,61個(gè)顛換,轉(zhuǎn)換與顛換比率為2.16。此外,對(duì)兩個(gè)菌株序列進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)了41個(gè)插入/缺失位點(diǎn)。從34個(gè)片段中選擇4個(gè)片段,分別比較菌株內(nèi)的SNPs情況。X-WC的菌株內(nèi)SNP發(fā)生率為每個(gè)核苷酸1.308%(30/2293),X-LY的菌株內(nèi)SNP發(fā)生率為每個(gè)核苷酸1.352%(31/2293)。序列圖譜中有31個(gè)重疊峰,表明菌株X-LY的菌核是異核體。 

【基金】Supported by the Key Scientific Research Fund of Hunan Provincial Education Department(No.08A044)； National Natural Science Foundation of China(No.30770010)； the Program for Excellent Talents in Hunan Normal University(No.2008-6)；

【關(guān)鍵詞】黑柄炭角菌; 分子標(biāo)記; 單倍型; 異核體;