【作者】李倩 閆淑珍 陳雙林
【機(jī)構(gòu)】南京師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院
摘要：絨泡菌目Physarida是黏菌綱Myxogastria最大的一個目,對其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的研究一直是根據(jù)形態(tài)特征。為了從分子水平探討絨泡菌目乃至黏菌綱的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,以黏菌r DNA ITS通用引物對絨泡菌目5屬8種黏菌的r DNA ITS進(jìn)行擴(kuò)增和測序,結(jié)合Gen Bank中已有的黏菌r DNA ITS序列,利用貝葉斯推斷法(Bayesian inference,BI)和最大似然法(Maximum likelihood,ML)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明:絨泡菌目不同物種的r DNA ITS區(qū)在堿基組成和長度上差異明顯,長度為777–1 445bp,G+C mol%在53.4%–61.9%之間。絨泡菌目與發(fā)網(wǎng)菌目Stemonitida聚類為兩個明顯的分支,在絨泡菌目分支上,絨泡菌科Physaraceae和鈣皮菌科Didymiaceae各聚為一支,支持了形態(tài)學(xué)上以孢絲是否具有石灰質(zhì)為依據(jù)區(qū)分這兩個科的觀點(diǎn)。由多份不同地理來源的鱗鈣皮菌Didymium squamulosum材料組成的鈣皮菌科又形成3個分支,證實(shí)了這個形態(tài)種是由地域來源廣泛、繁殖親和性各異和遺傳變異較大的不同生物種組成的復(fù)合體。
基金：國家自然科學(xué)基金(31170014)； 江蘇省高校自然科學(xué)研究重大項(xiàng)目(12KJA180004)；
關(guān)鍵詞：黏菌; 核糖體DNA內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū); 分子進(jìn)化; 最大似然法; 貝葉斯分析;
【機(jī)構(gòu)】南京師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院
摘要：絨泡菌目Physarida是黏菌綱Myxogastria最大的一個目,對其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的研究一直是根據(jù)形態(tài)特征。為了從分子水平探討絨泡菌目乃至黏菌綱的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,以黏菌r DNA ITS通用引物對絨泡菌目5屬8種黏菌的r DNA ITS進(jìn)行擴(kuò)增和測序,結(jié)合Gen Bank中已有的黏菌r DNA ITS序列,利用貝葉斯推斷法(Bayesian inference,BI)和最大似然法(Maximum likelihood,ML)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明:絨泡菌目不同物種的r DNA ITS區(qū)在堿基組成和長度上差異明顯,長度為777–1 445bp,G+C mol%在53.4%–61.9%之間。絨泡菌目與發(fā)網(wǎng)菌目Stemonitida聚類為兩個明顯的分支,在絨泡菌目分支上,絨泡菌科Physaraceae和鈣皮菌科Didymiaceae各聚為一支,支持了形態(tài)學(xué)上以孢絲是否具有石灰質(zhì)為依據(jù)區(qū)分這兩個科的觀點(diǎn)。由多份不同地理來源的鱗鈣皮菌Didymium squamulosum材料組成的鈣皮菌科又形成3個分支,證實(shí)了這個形態(tài)種是由地域來源廣泛、繁殖親和性各異和遺傳變異較大的不同生物種組成的復(fù)合體。
基金：國家自然科學(xué)基金(31170014)； 江蘇省高校自然科學(xué)研究重大項(xiàng)目(12KJA180004)；
關(guān)鍵詞：黏菌; 核糖體DNA內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū); 分子進(jìn)化; 最大似然法; 貝葉斯分析;