【作者】 汪虹； 陳明杰； 鮑大鵬；
【Author】 WANG Hong,CHEN Mingjie,BAO Dapeng National Engineering Research Center of Edible Fungi;Shanghai Key Laboratory of Agricultural Geneticsand Breeding;Institute of Edible Fungi,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai 201403,China
【機構】 農業部南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術研究中心上海市農業遺傳育種重點開放實驗室上海市農業科學院食用菌研究所；
【摘要】 根據擔子菌絲/蘇氨酸蛋白激酶同源基因編碼的氨基酸序列設計兩對簡并引物,通過巢式簡并PCR方法獲得草菇(Volvariella volvacea)絲/蘇氨酸蛋白激酶同源基因(vv-stpk1)的保守片段,然后通過基因組步行的方法獲得了vv-stpk1全長序列。vv-stpk1全長為2 003 bp,含有8個內含子,長度分別為72、57、53、54、45、50、55和48 bp,可編碼522個氨基酸殘基的多肽。推定的氨基酸序列與玉米黑粉菌(Ustilagomaydis)、木糖發酵酵母(Pichia stipitis)、新型隱球菌(Cryptococcus neoformans)中與細胞形態發生相關的絲/蘇氨酸蛋白激酶Orb6的相似性分別為81%、77%和76%,對VV-STPK1蛋白的系統發生學分析的結果表明,VV-STPK1與Orb6同源蛋白聚在同一進化枝上,這些數據都支持VV-STPK1蛋白為與細胞形態發生相關同源蛋白的推定。
【Abstract】 Two pairs of degenerate primers,designed according to the conserved amino acid sequences of several basidiomycete ser/thr protein kinases,were used in nested PCR to amplify the corresponding conserved DNA sequence from Volvariella volvacea.The complete DNA sequence of the ser/thr protein kinase(vv-stpk1) was then obtained by genome walking.vv-stpk1 was 2 003 bp in size,encoding for 522 amino acids,and contained eight introns.VV-STPK1 exhibited 81%,77% and 76% similarity with Orb6,a ser/thr prote...
【關鍵詞】 草菇； 絲/蘇氨酸蛋白激酶； 克隆； 序列分析；
【Key words】 Volvariella volvacea； ser/thr protein kinase； gene clone； sequence analysis；
【基金】 上海市農業科學院院發基金[編號:上海農科院農科發2008(16)];上海市科委科技攻關重點項目(編號:10DZ2212400)的部分研究內容
【分類號】S646.13