有機金針菇心灰霉病多數是由于缺乏微量元素所致，而缺素多為缺鐵和鋅。缺素的原因是由于根系受傷吸收不良，是氣溫低、不良環境增多的情況下多發。
1.溫度金針菇的各生長階段對溫度要求不同，菌絲體生長的溫度范圍是3～34℃，最適溫度23℃左右;子實體分化要求的溫度為10～15℃，最適宜溫度為 12～13℃，原基可在10～20℃的范圍生長，超過23℃，形成的原基會萎縮消失。子實體正常生長所需的溫度為5～20℃，最適溫度為8～12℃，子實體發生后在4℃下的冷風短期抑制處理，可使金針菇發生整齊，菇形圓整。
2.濕度金針菇菌絲生長階段，要求培養料的含水量在60%～68%，實踐證明，根據培養料質地不同，適當增加培養料的含水量，能起到一定的增產作用。培養料水分如低于50%，菌絲生長稀疏，結構性不好;水分高于75%，則通氣不良，菌絲生長緩慢或停止生長。子實體形成培養料最適含水量為65%，低于50%子實體不會形成。原基分化時空氣相對濕度保持在80%～85%;子實體發育階段，要求較高的空氣相對濕度，除依靠本身的水分來滿足菇體生長發育外，空氣相對濕度應提高到85%～95%。
3.空氣有機金針菇是好氣性真菌，必須有足夠的氧氣供應才能正常生長，因此菌絲體生長階段和子實體發育階段，需要足夠的氧，否則，菇的生長緩慢，菌柄纖細，不形成菌蓋，成針尖菇。金針菇的子實體對空氣中的二氧化碳濃度很敏感，當二氧化碳含量超過1%時就抑制菌蓋的發育，超過5%時，便不能形成子實體。
4.光線金針菇是厭光性菌類，菌絲在黑暗條件下能正常生長，原基在完全黑暗下也能形成。子實體生長階段，一定的散射光線對子實體的形成有促進作用。
5.酸堿性金針菇需要弱酸性的培養基，在pH3～8.4范圍內皆可正常生長。菌絲體生長階段，培養料的pH最適值是4～7，在一定的pH范圍內，培養料偏堿會延遲子實體的發生，微酸性的培養料，菌絲體生長旺盛。子實體在pH5～6時產生最多最快，培養料中pH低于3或高于8，菌絲停止生長或不發生子實體。
