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    松乳菇ITS序列比較及其在乳菇屬中的系統發育分析


    【發布日期】:2013-10-15
     【作者】 陳玉華; 劉君昂; 周國英; 李河; 王圣潔; 路宗巖; 
     
    【Author】 CHEN Yuhua2,LIU Jun’ang1,2,ZHOU Guoying1,2*,LI He1,2, WANG Shengjie2,LU Zongyan2 1Key Laboratory for Non-wood Forest Cultivation and Conservation of the Ministry of Education,Central South University of Forestry and Technology,Changsha,Hunan 410004,China;2College of Forestry,Central South University of Forestry and Technology,Changsha,Hunan 410004,China
     
    【機構】 中南林業科技大學林學院; 經濟林培育與保護教育部重點實驗室,中南林業科技大學; 
     
    【摘要】 提取江蘇、云南、江西、湖南、廣西、安徽、湖北地區的松乳菇(Lactarius deliciosus)、紅汁乳菇(L.hatsudake)、橙色乳菇(L.akahatsu)和鮭色乳菇(L.salmonicolor)共25個子實體樣本的基因組DNA,擴增ITS序列,對GenBank下載和本次及以前測序的松乳菇ITS序列的堿基組成、變異位點及堿基替換類型進行分析,從GenBank下載乳菇屬其它8個種,構建乳菇系統發育樹。結果顯示:松乳菇ITS序列共有20 bp長度的變化,堿基C、T含量大于G、A含量。變異位點ITS共有99個(ITS1 58個、5.8S 4個、ITS2 37個),其中主要是T與C的轉換,轉換與顛換位點數分別為8和5。ITS1、5.8S、ITS2中轉換與顛換的比值R分別為2.34、1.95、1.12。基于ITS序列計算不同地區松乳菇間的遺傳距離,江西與意大利、西班牙,法國與西班牙序列間的遺傳距離最大為0.012,云南和法國序列間遺傳距離為0,是同源序列。系統發育樹顯示:松乳菇和紅汁乳菇、橙色乳菇親緣關系較近。
     
    【關鍵詞】 松乳菇; ITS序列; 系統發育; 
     
    【基金】 國家自然科學基金項目(編號:30972371)的部分研究內容
     
    【分類號】S646
     
     
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