【作者】呂貝貝 于海龍 祝子坪 蔣瑋 何建華 吳瀟 李鵬 王金斌 武國(guó)干 譚琦 唐雪明
【機(jī)構(gòu)】上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所 臺(tái)州學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院
摘要：為了培育草菇耐低溫菌株與解析其耐低溫的分子機(jī)制,采用紫外誘變的方法,選育出耐低溫草菇菌株Vtlt-1,并利用表達(dá)譜芯片技術(shù),比較突變菌株Vtlt-1與原始菌株V23的表達(dá)差異基因,篩選差異顯著基因后利用GO(gene ontology)功能注釋和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集等方法分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與V23相比Vtlt-1表達(dá)顯著差異基因共有1 600個(gè),其中704個(gè)基因上調(diào)表達(dá),896個(gè)基因下調(diào)表達(dá)。針對(duì)差異基因的GO功能分類結(jié)果發(fā)現(xiàn):生物學(xué)過(guò)程方面,差異基因主要分布在金屬離子結(jié)合、氧化還原過(guò)程、碳水化合物的代謝與核酸的結(jié)合。細(xì)胞組分方面主要與細(xì)胞核相關(guān);分子功能中,氧化還原活性以及解旋酶活性,依賴于ATP的解旋酶活性、DNA指導(dǎo)的RNA聚合酶活性。KEGG注釋結(jié)果發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因主要富集在氨基酸與氮類物質(zhì)的代謝、脂肪酸與生物堿的合成這兩方面,此外還富集到核糖體的生物合成、細(xì)胞色素P450、RNA聚合酶、硫和氨基酸的代謝、核酸的修復(fù)等通路。這些結(jié)果為解析草菇耐低溫機(jī)制提供分子依據(jù)和理論基礎(chǔ)。
基金：國(guó)家博士后基金(2013M531197)； 上海市博士后基金(13R21421000)； 上海市市級(jí)農(nóng)口系統(tǒng)青年人才成長(zhǎng)計(jì)劃[滬農(nóng)青字(2014)第1-15號(hào)]； 上海市農(nóng)委科技興農(nóng)項(xiàng)目[滬農(nóng)科攻字2015第(5-6)號(hào)]~~；
關(guān)鍵詞：草菇; 表達(dá)譜芯片; 耐低溫; KEGG代謝通路分析;