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    土壤中立枯絲核菌AG3菌核的熒光定量PCR快速檢測


    【發布日期】:2019-01-25  【來源】:菌物學報
    【作者】申永銘郭成瑾王喜剛沈瑞清陳愛昌胡小平
    【機構】西北農林科技大學植物保護學院旱區作物逆境生物學國家重點實驗室寧夏農林科學院植物保護研究所甘肅定西市植保植檢站
    摘要:立枯絲核菌Rhizoctonia solani融合群3(anastomosis group 3,AG3)是引發馬鈴薯黑痣病的主要病原菌,嚴重威脅著馬鈴薯產業的發展。菌核是馬鈴薯黑痣病菌在土壤中的主要存活結構,是馬鈴薯黑痣病的初侵染源,其密度直接影響馬鈴薯黑痣病的發病率和嚴重程度。為快速準確地檢測出土壤中菌核的密度,本研究以立枯絲核菌AG3轉錄間區(ITS)特異性引物RsTqF1/RsTqR1擴增產物的重組質粒為標準品,構建SYBR Green I實時定量PCR(q PCR)檢測體系,結合水篩法與Fast DNA?Spin Kit for Soil土壤DNA提取試劑盒對土壤樣品進行DNA提取,建立了循環域值(Ct)與土壤中立枯絲核菌AG3菌核密度的關系,并與傳統選擇性培養基篩選法進行比較。結果表明,實時定量PCR檢測靈敏度比常規PCR高10倍,土壤中菌核密度n(g/g土)和Ct值之間的關系為:n=10(9.6917‐Ct)/3.4558。相比較于選擇性培養基篩選法,水篩q PCR法能夠更加快速準確地檢測出土壤中立枯絲核菌的菌核密度。 
     
    基金:寧陜科技合作項目~~;
     
    關鍵詞:實時定量PCR; 水篩法; 馬鈴薯黑痣病;
     
     
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