【作者】于慧云王嘉薈胡小平范三紅

【機構】旱區作物逆境生物學國家重點實驗室西北農林科技大學生命科學學院植物保護學院

摘要：Helitron是真核生物中存在的一種以滾環方式進行復制的轉座元件,關于其對動植物基因組的影響已有深入分析,而在真菌中則鮮有報道。本文對大豆囊孢線蟲的生防菌——明尼蘇達被毛孢Hirsutella minnesotensis中的Helitron轉座元件進行了系統分析,發現該真菌中存在兩類自主的Helitron元件HmHeli1和HmHeli2;其中HmHeli1不僅具有保守的末端序列和結構,而且編碼序列高度相似,甚至完全一致的Rep Hel轉座酶,表明其在基因組中發生了近期擴張并依舊活躍。HmHeli1符合Helitron2元件的結構及編碼特征:5′和3′末端分別存在保守序列"TCAG"和"TATTTT",3′末端存在富含GC的發卡結構,近末端存在不對稱的反向重復序列;編碼的轉座酶包含鋅指、Rep和Helicase結構域,但不包含核酸內切酶結構域。HmHeli1優先同向插入基因富集區,甚至功能基因內部,插入位點存在一個短的富含AT的序列。HmHeli1不具主動捕獲基因的能力,但可被動接受其他轉座元件的插入。HmHeli1是一種結構獨特、極具擴張力的DNA轉座元件,不僅在明尼蘇達被毛孢基因組進化中發揮著重要作用,并且具有開發為通用遺傳分析工具的潛能。 

 

基金：中央高校基本科研業務費專項(2014YB032)； 寧陜科技合作項目~~；

 

關鍵詞：明尼蘇達被毛孢; HmHeli1; Helitron2; 末端反向重復; 基因富集區;