原因一：品種選用
根據氣候條件，引進其他品種前應先小范圍試驗，適宜本地栽培后再大面積推廣。另外，引進菌種本身種性退化，制種技術欠缺、操作不規范，菌種多次傳代保存，以四級甚至五級菌種作為三級種播種等，均會影響出菇。退化菌種表現為接種后萌發慢、菌絲弱、發菌慢、抗逆性差。遲遲不出菇或出菇少，嚴重者病害肆虐，導致生產失敗。防治菌種退化最好掌握制種技術，直接制種用于生產，無制種條件的需購買正規三級種栽培。
原因二：培養料配制
培養料配方合理才能正常出菇，否則會導致氣生菌絲多、病害嚴重、遲遲不出菇。
基本配方：麥草3000公斤、牛糞粉3000公斤、過磷酸鈣60公斤、尿素60公斤、石灰粉80公斤、石膏粉80公斤、碳酸鈣90公斤、“賽百09”1.5公斤、食用菌三維營養精素1.44公斤。發展沼氣較好的地區可以加入適量沼渣，也可以采用沼液拌料。
培養料的發酵處理關系著栽培能否成功，生產上存在培養料發酵不均勻、原料生熟不一、酸化等現象，導致發菌困難、污染嚴重、出菇難。建議改用二次發酵技術，使培養料發酵均勻一致。習慣采用一次性發酵的，翻堆時按照“內外相換、上下相調”的原則，不要“一邊倒”式翻堆，并在進棚前對培養料含水率、PH值等進行檢查調整。
原因三：防治病蟲
病蟲潛伏于培養料中，播種后對雙孢菇菌絲造成危害，導致出菇困難或不出菇。解決方法：徹底清理菇棚及周圍環境衛生;用“百病傻”處理覆土，發菌和出菇階段每隔3～7天噴施一次;在菇棚通風口和進風口出撒施石灰粉，以防害蟲爬入。
原因四：菇棚管理
棚溫過高或過低，含水量過大、滲水、菌絲自溶、盲目用藥、菌絲生理不成熟等，均可導致不出菇。溫度降至8℃以下時一般不再出菇，采取生火爐等方式加溫也無法滿足正常出菇時，應進入冬季管理階段。打開通風孔使棚溫繼續下降，但要始終保持遮陰條件，不能讓直射光進入。不再噴水強通風，使棚內溫度降至60%以下。降濕后覆土很快失水，一般含水率可達20%以下，甚至更低，至春季氣溫回升后含水率可降至10%左右，土面發白呈松散狀。停止用水后噴灑“賽百09”300倍液，以后每隔15天噴一次。噴施5%氯氰菊酯乳油100倍液，殺滅殘存害蟲，棚外地面解凍后每隔10天噴施一次。撒施滅鼠藥，防治老鼠危害菇床。有條件的地方可以安裝水溫空調，升溫至15℃左右。
