食用菌對環境條件反應敏感，如不良的環境生活條件(如溫、濕、氣等不協調)，使食用菌生長發育出現生理障礙，產生各種異常現象甚至死亡。而今正值食用菌生產旺季，如不加強管理，會給菇農造成嚴重損失；現將常遇到的一些生理性病害及防治措施作簡要介紹。
致病原因主要是管理不當，菇房通風透氣不良，栽培料面和覆土濕度大，適于菌絲生長而不利于子實體形成，有時與菌種本身有關。
防治措施：在覆土調水后或香菇菌絲愈合期，要加強菇房通風，增加透氣性，以降低二氧化碳濃度和空氣濕度，同時降低菇房溫度，抑制菌絲生長，促進子實體形成。如表面已形成菌塊，可用刀劃破菌塊，噴水通風，仍能形成子實體。
2、子實體畸形。 主要發生在平菇、香菇、靈芝等，發生時子實體形狀不規則，蓋小柄大，歪斜等，子實體不分化，菌蓋形不成，嚴重時只形成一個不分化的組織塊。
病因主要來自機械性損傷和覆土粗糙、出菇部位過低，壓擠、碰損等，及菇房光線不足或二氧化碳濃度過高，都可能造成菌蓋小，不開片、柄細長等畸形菇，另外像病毒危害、藥害及物理化學誘變劑作用，也可形成畸形菇。
防治措施：減少機械創傷，加強通風透光，防止病毒感染，正確使用有關藥劑，避免藥害影響，恰當選用誘變劑，篩選遺傳性狀優良的突變體。
3、死菇現象。 在出茹期間并無病蟲危害，而從幼小的菌蕾到大小不等的子實體發生變黃、萎縮、停止生長而死亡。
病因：出菇過密，營養供應不足，小菇死亡；高溫、高濕、噴水重、通風不良，氧氣不足，小菇悶死，或噴藥次數多引起藥害及采菇不慎碰傷小菇等原因。預防時要針對以上原因，及早采取相應的措施加以避免。
4、水銹斑。子實體在菇房通風差，濕度大(＞95%)時，菌蓋表面常有積水的情況下或覆土中帶有鐵銹，都會使菌蓋表面產生銹斑，形似細菌斑點病，影響食用菌質量和產量。但水銹斑只限于菌蓋表皮，不深入肉內，如加強通風，及時蒸發掉菇體表面的水滴，不用帶鐵銹的覆土，即可防止其發生。
5、薄皮早開傘。在平菇旺產期，由于出菇過密，溫度偏高(18℃以上)，菇房內二氧化碳過高，很容易出現柄細長、蓋瘦薄、早開傘的子實體，嚴重
影響產量和質量，應及早預防。菌絲不要吊得太高，出菇部位掌握好，防止出菇過密，不噴潮頭水，不出潮頭菇。適當降低菇房溫度，可減少薄皮早開傘的發生。另外，還有硬開傘只在秋季低溫突臨時易發生。
因此，在食用菌栽培中，要協調好溫、濕、氣等因素，給食用菌生長創造良好的生活條件，使其健壯生長，就能避免上述生理性病害的發生。
