1.生產場地衛生條件差，污染源未及時妥善處理，導致雜菌量大，雜菌的孢子隨風、水、蟲、鼠等媒介傳播。
2.滅菌不徹底：高壓（常壓）滅菌設備不合要求；未達到規定的滅菌溫度或時間；裝料過多、過緊影響滅菌效果。
3.接種操作不當：接種室（箱）消毒不嚴；接種用具帶菌；操作人員技術不熟練。
4.包裝破損：菌種瓶（或袋）有破損、沙眼，封口來嚴密，棉塞等封口物受潮。
（三）防治方法
針對污染原因
1.搞好環境衛生，建立經常性環境消毒制度。
2.選用新鮮未霉變的原料。原料進行預堆發酵。用震林牌生物劑木耳死亡再生驅蟲劑拌料。
3.檢修滅菌設備。嚴格按要求進行滅菌和接種操作。
4.管理好菌絲培養階段的溫度、濕度和通氣等環境條件，避免發生高溫高濕和通氣不良而導致雜菌發生、蔓延。
5.勤檢查，早發現并及時消除被污染的瓶（袋）。妥善處理被污染的廢料，減少污采取相應的措施，堅持預防為主的原則。
