干泡病是雙孢菇的主要病害之一，病菌在雙孢菇發菌階段已形成侵染，并與雙孢菇菌絲同步生長，但暫時不表現出癥狀，出菇階段菌絲侵入。受害菌蓋出現暗褐色凹陷，并附著白色粉末；菌柄粗細不勻，畸形發育；病菇無水脹、無黏液、不發臭，最終呈干枯狀。病菌長期存活于土壤中，傳播途徑廣，從基料處理就應該開始預防。
1、選擇優質高抗性菌種。限于技術條件，目前還不能對該菌種進行脫毒處理，應引進高抗性適齡菌種。
2、對菌種培養室及菇棚消毒。徹底清理內外衛生，噴兩遍百病去無蹤藥液，并適量使用辛硫磷治蟲。
3、對基料二次發酵。病菌孢子在前期發酵時萌發，在二次發酵中很容易被殺滅，雖然成本稍高，但可防患于未然。
4、生長期管理。發菌期間每3-7天噴一次蘑菇殺病靈等藥劑抑制外來病菌。出菇期嚴格水、氣、溫、光等條件的調控，尤其要嚴格保持適宜的覆土層含水率及棚內通氣量，并堅持噴施藥物預防外來病菌。
5、發病后處理。如發現子實體有干泡病危害，應擴大1-2米范圍清除子實體及覆土材料，所有進棚工具用甲醛20倍稀釋液浸泡3小時，再投入到5%石灰水中消毒；新上覆土材料用百病去無蹤處理；菇棚內地毯式噴灑一次百病去無蹤；加強防蟲措施；將病殘體和覆土材料燒毀或深埋；對棚外及墻體噴灑多菌靈。
