冬季栽培平菇，管理不善容易產生各種畸形菇，降低商品價值，從而降低經濟效益。
1、大腳菇：原基發生后，菌蓋分化與發育速度不一致，表現為只長菇柄，下粗上細，不長菇傘，菌蓋的直徑小于柄的直徑而形成大腳畸形，這種菇的柄質較硬，商品價值較低。
預防措施：抓好通風和合理噴水。即使遇到連續低溫天氣，產菇期也要掌握在一天氣溫較高的時間內，進行短時間的通風換氣，噴水要勤，但不可一次噴水過重。
2、藍色菇：菇體生長過程中，菌蓋邊緣產生藍色暈圈，甚至整個菇體均變為藍黑色，直到采收時也不褪色。
預防措施：增溫措施采用日光、暖氣、電熱等方法為好。如果采取燒柴、燒煤來增溫，應裝置封閉的傳熱、排煙管道，不宜在菇室內直接搭建爐灶。
3、瘤蓋菇：菌蓋表面出現瘤狀或顆粒狀突起物，在菇內稱之為起泡或起皺，菌體表現生長緩慢。嚴重時，菌蓋僵縮，菇體停止生長。
預防措施：冬季栽植平菇時，必須弄清栽培品種的菇體正常生長發育能耐受的最低溫度，搞好保溫增溫措施，控制菇床溫度。采取變溫刺激措施時，也應控制在菇體發育的適宜溫度范圍內，而且降溫過程不要時間過長。一般中溫型品種應控制在8℃以上，低溫型品種應控制在0℃以上。
