球形或燒瓶形:平菇菌柄呈球形或燒瓶形，表面不平或扭曲成波浪狀，菌蓋不能形成，只有很小的一點或有明顯的冰凌狀條紋。這是病毒浸染所致，可用病毒k、病毒a和消菌靈等噴霧或涂抹防治。
花椰菜形:平菇子實體原基不斷增大，小柄強烈分叉，形成如同花椰菜狀的半球形。這是栽培環境中二氧化碳濃度過高、空氣濕度接近飽和所致，應加強通風，降低二氧化碳濃度和空氣濕度。
珊瑚形: 平菇菌柄不長粗或不形成菌蓋且繼續重復分叉，結果形成珊瑚狀，顏色為花白色。這是二氧化碳濃度過高和光照太弱所致，應加強通風，改善光照條件。
豆芽菜形:平菇菌柄細長，菌蓋極小或無菌蓋。這是菌蓋形成時溫度太低且持續時間過長所致，應在菌蓋形成期增溫保暖。
粗柄:平菇菌柄粗長呈水腫狀，菌蓋畸形，很小或沒有。這是平菇子實體分化期遇高溫、光照偏強和二氧化碳濃度過高，物質代謝受干擾，引起菌柄瘋長所致，應通風降溫，改善光照條件。
菇體皺縮干枯: 平菇生長瘦弱，子實體呈黃白色或淡黃褐色，菇體從上往下萎縮干枯。這是培養料缺水或空氣濕度過小所致，應及時給培養料補水。
形狀不規則: 平菇原基形成后，不分化形成菌柄和菌蓋，而長成不規則的菌塊，后期菌蓋扭曲開裂并露出菌肉。這是敵敵畏、速滅殺丁等農藥用量過多所致，應少用或不用農藥。
高腳菇: 菌蓋小，分化較差，菇柄較長。發生的原因是在原基形成并分化期，由于菇房缺氧，光照不足，同時溫度偏高，影響了菌蓋的正常分化和發育。防治方法:加強通風，調節光照和溫度。
瘤蓋菇: 菌蓋表現主要是邊緣有許多顆粒狀突起、色淺、菇蓋僵硬，生長遲緩。嚴重時菇蓋分化較差，形狀不規則。原因是菇體發育溫度過低，持續時間較長，致使內外層細胞生長失調。防治方法:調節菇房溫度，在平菇生長最低溫界限以上，并有一定溫差，促進菇體生長、發育、分化。
萎縮菇: 菇體初期正常，在膨大期即泛黃、水腫狀或干縮狀，而停止生長，最后變軟腐爛。水腫狀原因是濕度過大或有較多的水直接噴在幼小菇體上，使菇組織吸水，影響呼吸及代謝，停止生長死亡。干縮狀是因為空氣相對濕度較小，通風過強，風直接吹在菇體上，使平菇失水而死亡。或者培養基營養失調，形成大量原基后，有部分迅速生長，其余由于營養供應不足而停滯。防治措施:控制濕度在80~85%，不要向幼小菇體上噴水，不讓風直接吹在菇體上。合理配比培養料成分。少數萎縮菇是由于菌種退化，癥狀是菌蓋尚未長足夠大即反卷、發黃、萎縮。
防治方法:選用優良品種。
藍色菇: 菌蓋邊緣產生藍色的暈圈,有的菇體表面全部為藍色蓋覆。
發生原因。菇房內采用煤灶加溫,或者菇房緊靠廚房,由于煤炭燃燒時產生二氧化硫、一氧化碳等毒害氣體,加上通風換氣較差,造成菇體中毒,進而發生變色反應。
防治措施。冬季菇場增溫措施宜采用太陽能、暖氣、電熱等方法,如采用煤火、柴火等方法加溫,應設置封閉式傳熱的煙火管道,防止二氧化硫等有毒氣體進入菇房。
水腫菇:現蕾后菌柄變粗變長,菇蓋小而軟,逐漸發亮或發黃,最后水腫腐爛。
發生原因:濕度過大或有較多的水直接噴在幼小菇體上,使菇組織吸水,影響呼吸及代謝。
防治措施:加強通氣,增加菇體溫差刺激;菇蕾期盡量避免直接向菇體噴水,采取向地面和墻壁噴水的方式,以保持菇房空氣濕度。
空心菇:菌柄組織不充實,菌柄中心發白、中空。
發生原因:產菇旺期菇房相對濕度過低,粗土層過干,使菇體得不到充足的水分,菌柄中產生白心,甚至出現空心。
控制措施:加大噴水量,在子實體生長期,要將空氣濕度調控在85%~95%;調節好粗土粒的溫度,含水量以25%為宜,防止土層偏干而影響子實體的正常生長與發育。
光桿菇: 平菇菌柄細長,菌蓋極小或無菌蓋。
發生原因:由出菇期間低溫引起的。而平菇菌蓋的形成要求的溫度較高,當菌柄在較低溫度下伸長到一定高度時,氣溫仍在0℃左右,并維持較長時間不回升,菌柄表面有冰凍現象,雖不死亡,但菌蓋不能分化形成。
防治方法:在子實體生長發育階段,如遇0℃左右氣溫,要采取增溫保暖措施,提高菇房溫度。
