平菇枯萎：菇蕾或子實體生長停滯，逐步萎縮、變干枯死、腐爛。發生的原因主要是水分不足，通風過大。防治辦法：增加空氣相對濕度，不使料面干燥，通風時切勿讓風直吹菇蕾或子實體。
平菇藥害：子實體噴藥后（敵敵畏），菌蓋停止生長，邊緣形成一條黑邊、翻卷。防治方法：要禁止使用一些有害的農藥。
平菇銹斑：平菇菌蓋、菌柄上產生銹褐色斑點。發生的原因，主要是通風不良、濕度過大形成的。防治辦法：加強通風，降低濕度。
平菇褐斑病：主要危害其正常生長。其癥狀為子實體表面產生白色絨毛狀菌絲，出現褐色斑點，菌蓋萎縮、干裂。 防治法：降低溫度，加強通風。病區噴2％甲醛液或1：500倍多菌靈。
