及時清理料面。子實體菌蓋直徑達1－1.5厘米、菌柄長14－15厘米時采收，采收后及時清除料面上殘留的菇腳及小菇，剔除個別料面上板結的老菌絲，盡量減少機械損傷，保護好原有菇原基。
適當通風降溫。在出菇階段，為了采收到蓋小、柄長、色淺、肥嫩的優質金針菇，一般在菌袋上覆蓋一層地膜，以保證金針菇生長所需的濕度，并創造一個二氧化碳濃度較高的微環境。但高濕度、高二氧化碳濃度又不利于重新催蕾，可在早晚揭膜通風透氣，使其盡快形成原基，加速轉潮。
給予微弱的散射光。金針菇完全可在黑暗環境中形成菇原基，但形成的數量遠不及在微弱散射光環境下形成的多，因而在轉潮時要給予一定的散射光，“三分陽、七分陰”的環境可加快菇原基分化，使其形成菇蕾。
合理調控溫度。金針菇原基形成的最適溫度為13－15℃。如果氣溫偏高，可在菇房空閑地加大噴水量，全面通風降溫。應注意的是，溫度高時濕度不能太大，否則會使菇腳變黑，絨毛增多，進而引起病害。如果氣溫偏低，可以噴灑熱水或給菇房加溫，以避免因溫差過大而延緩菇原基的形成，影響菇蕾的生長，不利于轉潮。
培養料的含水量要適宜。培養料的含水量必須達65%~70%時才能保證其正常生長及后期順利轉潮。如果培養料較干，可一次在袋內加入較多的清水，2－4個小時后倒出多余的水，每袋補充50－100毫升即可。
掉頭出菇第二潮菇采摘后，應掉頭在另一端出菇，可使轉潮加快，產量與第一潮菇相當。但要注意的是，菌絲沒有發透或有雜菌感染的菌袋不宜掉頭出菇。
防四周出菇。袋栽金針菇常出現四周出菇，中間沒有或很少出菇的現象，可在培養料中加入20%的雜木屑，不僅可防止四周出菇，還能促進菇原基的形成。
