【作者】龔明 鮑大鵬 唐傳紅 張勁松
【機構】上海市農業科學院食用菌研究所農業部 南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術研究中心 國家食用菌加工技術研發中心 上海市農業遺傳育種重點開放實驗室
摘要：對"滬靈芝"(Ganoderma lucidum SH)等23個真菌物種進行全基因組系統發生分析,進一步選取其中具有代表性的物種進行比較基因組學分析。全基因組系統發生分析和分子鐘估計結果顯示,滬靈芝分化時間(8.75百萬年前)明顯晚于靈芝屬分化時間(180百萬年前);基因家族尺寸和直系同源基因數目分析顯示,與另外參試靈芝菌種相比滬靈芝基因家族具有一定的收縮趨勢;進一步對基因家族數目進行比較的結果顯示,滬靈芝逆轉錄酶家族發生了顯著擴增。GO功能分析提示滬靈芝逆轉錄酶家族的功能富集主要為核酸結合功能和酶的催化活性。
基金：上海市農科發2013(10)； 上海市科技興農重點攻關項目[滬農科攻字(2014)第7-1-7號]； 國家自然科學基金(31401933)資助；
關鍵詞：靈芝; 全基因組分析; 分子鐘; 基因擴增; GO功能分析;