采摘有機香菇要掌握最佳采收期。有機香菇的成熟標志是菌膜已破，菌蓋尚未完全開展，尚有少許內卷，形成“銅鑼邊”，菌褶已全部伸長。適時采收的香菇，色澤鮮艷，香味濃，菌蓋厚，肉質軟韌，商品價值高。過期采收，菌傘充分開展，肉薄、腳長、菌褶變色，這時，它的重量減輕，商品價值低。
注意采摘技術。摘菇時左手拿起菌棒，右手用大拇指和食指捏緊菇柄的基部，先左右旋轉，擰下即可。不讓菇腳殘留在菌筒上霉爛，影響以后出菇。如果成菇生長較密，基部較深，要用小尖刀從菇腳基部挖起，注意保持朵形完好。
天氣影響。采收香菇還要根據氣溫、氣候的變化，采取不同措施，分期分批進行。氣溫低時，香菇生長慢，可適當延長采收期；如遇陰雨天，寧可提前采摘稍嫩的菇，而不采過熟菇。
配合適盛器。采完的鮮菇，要用小蘿筐或小籃子裝，并要小心輕放，保持實體完整，防止互相壓擠損環，不能影響品質。采下的鮮菇要按菇體大小、朵形好壞進行分開，不能混在一起，然后另裝盛器內，以便分等加工。
采前停止噴水。部分菇農在采前噴水以增加重量，這嚴重影響品質。如果采前噴水，菇體含水量高，加工鮮菇時菌褶變褐，脫水干制時菌褶變黑，菇體水分過高也容易發霉。因此，在采收前不能噴水，讓菇體保持原來水分。
