林間黑木耳正常情況下應出3茬耳，但目前有些頭茬耳采收后，沒等2茬耳長出就感染了雜菌，造成2～3茬耳產量降低，甚至絕產，影響了效益。
一、轉批耳雜菌污染原因
⑴暑期高溫。袋內溫度超過38℃，菌體蛋白即變性，導致菌絲死亡，菌絲體逐步變軟、吐黃水，在采耳處首先感染青霉菌等雜菌，最后全部感染。
⑵采耳過晚。采耳晚會使子實體失去彈性，老化，體內營養外流，造成爛耳。
⑶上茬耳耳根沒清理干凈。殘留的耳根，因傷口外露，易直接感染雜菌。
⑷菌絲體斷面沒愈合。采耳時菌絲體產生新斷面，長勢很弱，抗雜菌能力差，這時澆水催耳，很容易產生雜菌感染。
⑸ 草簾子腐爛發霉。蓋在栽培袋上遮陽保濕的草簾子，由于澆水過勤，造成出2茬耳時，已發霉腐爛，感染雜菌，并使栽培袋感染雜菌。
⑹床面未清理。采耳后的床面，常會散落采耳時掉下的培養基、子實體及草簾子掉下來的廢棄物，蓋上草簾澆水后，產生雜菌，而后蔓延到栽培袋上。
⑺草簾子、床面濕度大。采完耳后，在2茬子實體形成前，菌絲體有個愈合斷面，休養生息，積聚營養，高溫低濕的階段。倘若采耳后直接將袋擺在潮濕的出耳床上，蓋上濕草簾，潮濕不見光，則很易產生雜菌污染。
⑻采耳后的栽培袋未經直射光干燥。采耳后將袋直接放在直射陽光下降濕殺菌，可抑制霉菌生長，菌絲愈合恢復快。但應注意避開中午高溫強光。
⑼澆水過早過勤。采完耳的袋，2茬耳子實體還未形成和封住采耳處，就過早澆水，也會產生雜菌感染。
二、為防止雜菌污染，盡早形成下茬耳
⑴及時采耳。子實體朵片充分展開，邊緣變薄起褶子，耳根收縮時便可采收。這時采收的黑木耳彈性強，營養不流失，質量最好。
⑴及時采耳。子實體朵片充分展開，邊緣變薄起褶子，耳根收縮時便可采收。這時采收的黑木耳彈性強，營養不流失，質量最好。
⑵子實體連根摳凈。采耳時掀開草簾，讓陽光照射，使子實體水分下降，子實體適度收縮，采收時不易破碎，利于連根拔下。拔凈根利于下茬耳形成，無殘留耳根可抑制霉菌生長。
⑶草簾定期消毒。草簾一直裸露在外，并含有大量水分，極易產生雜菌。因此，必須在出耳前、采耳后用克霉王消毒，以防草簾腐爛或生雜菌。
⑷清理床面，徹底消毒。采完耳的床面移開草簾和栽培袋，將床面殘留的培養基、子實體，草簾子掉下的殘余物清理干凈，然后用克霉王、甲基托布津等藥物消毒。
⑸栽培袋、出耳床、草簾必須干曬。栽培袋應避開正中午曬，袋每面都應曬著，曬3～5小時，使采耳處菌體表面干燥。床面和草簾應徹底晾曬。擺上曬完的袋，蓋上曬干的簾子，養菌7～10天，然后按第1茬出耳方法管理。這階段要注意通風，嚴防超溫。
⑹安排適宜出耳期。子實體生長期應盡量選擇在當地氣溫10～25℃。如遇高溫，可掀起草簾，曬干袋上生長的耳，使它停止生長，防止爛耳，待溫度下降后再澆水繼續管理出耳。
⑺生產3茬耳時，因出耳后勁不足，耳片生長緩慢，故要減少噴水次數與噴水量。當耳片生長明顯停滯時，應掀起草簾，讓陽光（避開強光）將耳片、床面曬干，再蓋上草簾，2～5天后噴水，注意勤噴、噴霧。注意澆就澆透，干就干透，否則影響木耳正常生長。可結合澆水，追施菇豐素、三十烷醇等營養液。
