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    基因組解析推動靈芝成為藥用模式真菌


    【發布日期】:2012-07-20  【來源】:國家自然基金委
      《自然》 子刊 《Nature Communications》近期發表了中國醫學科學院藥用植物研究所陳士林課題組與美國、法國等合作單位關于基因組解析推動靈芝成為藥用模式真菌的論文,并以特別圖片(Featured Image)形式進行了推介,隨后《今日美國》(US TODAY)以“揭秘中國‘仙草’基因組”為題報道了該研究成果。該研究得到了國家自然科學基金委員會重點項目(項目編號:81130069)等項目的支持。
      該課題組應用光學圖譜和新一代測序技術,自主完成染色體水平靈芝基因組精細圖譜,研究顯示,靈芝基因組大小約43.3Mb,由13條染色體組成,編碼16,113個預測基因,其中包括多種細胞色素P450、轉運蛋白和調控因子等與次生代謝產物合成、運輸和調控相關基因,是研究真菌次生代謝的理想模式物種。該研究由中國醫學科學院藥用植物研究所牽頭組織聯合美國田納西大學健康科學中心、美國威斯康星大學麥迪遜分校、法國埃克斯-馬賽大學、中國中醫科學院、美國國家綜合進化研究中心等機構的學者組建國際化研究團隊,對靈芝基因組圖譜進行全面解析,深入探討靈芝藥用活性物質的合成途徑及其調控機制,提出將靈芝作為中藥有效成分生物合成研究的藥用模式物種。
      生物學家通過對選定的生物物種進行科學研究,用于揭示某種具有普遍規律的生命現象,這種被選定的生物物種被稱為模式生物。靈芝具有模式生物的鮮明特征:易于在實驗室內培養和繁殖、世代短、子代多、遺傳背景清晰、容易進行實驗操作、對人體和環境無害。隨著生物學研究進入基因組時代,模式生物學研究策略受到更廣泛的關注,某些物種基因組的測序完成通常也會推動該物種向模式生物發展。與酵母等低等真菌相比,靈芝具有更復雜的有性生殖世代和更明顯的形態建成與分化;與高等藥用植物相比,靈芝具有更小的基因組和更短的世代周期。此外,靈芝遺傳轉化體系成熟,化學成分清晰,使其成為研究中藥活性成分合成與調控的理想模式物種。靈芝基因組精細圖的完成將加強靈芝在次生代謝產物合成與調控、次生代謝與發育相關性等研究領域的模式作用,推動中藥有效成分生物合成研究走向快速發展之路。全基因組解析推動靈芝成為中藥活性成分生物合成研究的首個藥用模式真菌,靈芝模式物種的確立將促進我國中藥學研究與現代生物學研究的結合,中藥研究正逐步走向生命科學的前沿。
     
    關鍵詞: 靈芝 基因
     
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