一些老菇場由于滅菌消毒不徹底，病害防治不到位，害蟲發生嚴重等原因，產量不斷下降，效益降低。應采取有效措施，保證老菇房成功發菌，增加效益。
　　外圍環境消毒 清潔菇棚周圍環境。糞堆、草堆、垃圾等應清理干凈，將雜草一并清除，并噴灑多菌靈等殺菌劑，徹底清潔環境。
　　棚內消毒 用多甲溶液（多菌靈、甲醛、水比例1∶2∶100）對棚內進行地毯式噴灑，墻體、墻角、立柱、通風孔等都應噴到，不留死角。對于土棚，應把內墻面鏟去3～5厘米厚再消毒。
　　曬棚 出菇結束后，揭掉遮陽物和棚膜，對可拆的竹木拆掉后用0.1％～0.2％高錳酸鉀溶液洗刷干凈，利用太陽強光長時間暴曬竹木和菇棚（可雨淋）。10～15天后啟用。該項措施能夠較徹底殺滅棚內病毒、病菌。
　　更換架桿棚膜 對病害發生嚴重的菇棚，可拆除上層架桿、塑料膜等物，棚內堆以秸稈雜草，點燃焚燒，將草灰翻入土中，重新架桿覆膜，再配以噴灑藥物，殺菌效果很好。靠近村莊、建筑物的菇棚不要采用該法，以免發生火災。
　　土壤處理 對于必須采用覆土栽培的菇類（雙孢蘑菇、雞腿菇等）和采用覆土方式栽培的菇類（平菇、高溫香菇、靈芝等），對覆土材料宜采用暴曬、藥物悶堆的方法消毒滅菌。鏟去老菇棚內10厘米以上的地表土，更換新土，或對地表土進行與覆土材料相同的處理。