一、注意補充菌料營養。
由于脫絨設備的改進，棉子殼上的絨毛變少變短，導致其吸水能力降低，透氣性變差;棉子油生產設備對棉子殼造成的破損數量減少，使棉子殼中所含的營養物質減少。因此，菇農必須增加一定的輔料，如豆餅、麩皮等補充營養。
二、選用新鮮的棉子殼。
如果是陳棉子殼，要經過高溫滅菌變成熟料才能栽培平菇。但現在多數菇農都是在9月之后才開始接種栽培平菇，為了操作方便，多是直接使用生料栽培。因此，這里要特別提醒菇農朋友，在購買棉子殼時，最好選擇沒有發生霉變的新鮮棉子殼。
三、掌握好菌種料水比。
由于塑料袋具有良好的保濕性能，制作三級菌種拌料時一定要嚴格掌握好料水比。如果培養料含水量偏低，則菌絲生長緩慢、纖弱;如果培養料含水量偏高，則透氣性變差，菌絲生長受阻。
四、抓好發菌期管理。
菌種發菌期要求避光、干燥，并注意發菌室通風換氣，這樣經過一個月左右菌絲即可長滿培養料。由于三級菌種發菌時間長，如果管理不當，很容易出現菌絲生長慢、感染雜菌、遭受蟲害等問題，導致發菌失敗。因此，一定要加強三級菌種發菌期的管理。
