近年來，北京食用菌產業發展較快，2009年北京食用菌總產量達到14萬噸，創年度產值9.8億元，主要分布在房山、通州、大興、順義、懷柔等郊區縣，食用菌產業已成為北京農業的一項重要產業，在北京食用菌產業發展中，北京市農林科學院發揮了重要作用。
     北京市農林科學院利用雜交育種等技術先后選育出二十余個食用菌優良新品種，如北京大木耳，香菇934、937、867，金針菇9309、金白一號，北京猴頭菌1號，平菇小白玉、黑平1號、2號、紅平菇，白靈菇10號、12號，杏鮑菇9號、13號、14號、16號、17號，草菇-農，茶樹菇-農，雞腿菇-農，秀珍菇-農，鮑魚菇-農，長根菇-農，大杯傘-農等，其中杏鮑菇14、16、17號獲國家發明專利授權。
     研發出多種食用菌栽培新技術，如：白靈菇和杏鮑菇關鍵栽培技術，高檔食用菌周年栽培技術，林地食用菌栽培技術，食用菌反季節栽培技術，利用廢棄礦道栽培食用菌技術等，這些優良品種及技術推廣到北京房山、通州、順義等郊區縣及周邊地區，累計推廣面積達5萬畝，創造經濟效益10億元，同時使北京食用菌良種覆蓋率由1987年的40%提高到目前的90%以上。
     針對北京地區高檔菇較少這一突出問題，經過三年試驗攻關，選育出白靈菇和杏鮑菇優良品種，并研發出白靈菇和杏鮑菇關鍵栽培技術，突破了白靈菇只出一潮菇的難題，使白靈菇和杏鮑菇產量增加近40%，每畝增加收入0.6萬元，累計推廣面積1.5萬余畝，創造經濟效益4.5億元，此項技術獲北京市科學技術二等獎。
     針對郊區林農短期效益和造林長期效益之間的矛盾，通過試驗攻關，選育出適合林地栽培的食用菌優良品種，并研發出林地食用菌高產栽培技術，在通州永樂店，房山琉璃河、蒲洼，順義楊鎮等地累計示范推廣2萬余畝，創造經濟效益4億元。林地食用菌栽培技術獲北京市農業技術推廣二等獎。